Microbiome intestinal

Selles (stabilisées)

Set M900571

Le microbiome intestinal


Définition du "microbiome intestinal" :
Le microbiome intestinal désigne l'ensemble des (co-)habitants microbiens de l'intestin humain, en particulier du gros intestin. Il s'agit principalement d'espèces bactériennes physiologiques et protectrices.

99% des bactéries qui colonisent un être humain font partie du microbiome intestinal. Globalement, on estime que celui-ci est constitué de dix à cent billions de bactéries appartenant à 500-1000 espèces différentes. Le nombre de gènes résidant dans le microbiome bactérien dans son ensemble est plusieurs fois supérieur au nombre de gènes humains (>2 millions de gènes bactériens contre >20 000 gènes humains). Les gènes bactériens prédominants se retrouvent principalement dans chaque microbiome intestinal humain, mais le microbiome de chaque personne est composé de manière individuelle.
Étant donné qu'il existe un degré élevé de redondance dans la fonctionnalité des gènes microbiens, les composants bactériens des différents microbiomes intestinaux peuvent être très hétérogènes.

Le microbiome intestinal humain est d'une complexité et d'une diversité sans précédent la plupart des bactéries appartenant aux quatre phyla bactériens : Bactéroïdes, Firmicutes, Protéobactéries et Actinobactéries représentant plus de 98 % du microbiote.

Les principales tâches du microbiome intestinal humain sont, entre autres, le métabolisme des composants alimentaires indigestes, la mise à disposition de ressources énergétiques importantes (acides gras à chaîne courte tels que le butyrate), la synthèse de vitamines et de substances essentielles (p. ex. vitamine K, folate), le métabolisme de différents agents thérapeutiques, polluants ou pesticides, ainsi que le développement et la stimulation du système immunitaire. Le microbiome intestinal humain influence également la plupart des systèmes de l'organisme, notamment le métabolisme des graisses, le système nerveux, l'homéostasie osseuse et l'angiogenèse.

La composition et la fonction du microbiome intestinal sont dynamiques, et sa structure est influencée par différents facteurs tels que l'alimentation, l’environnement, le mode de vie et la prédisposition génétique de l'hôte.


La santé commence dans l'intestin : le rôle central du microbiome intestinal

Les espèces bactériennes du microbiome, les fonctions du microbiome, l'homéostasie du microbiome et les interactions avec l'hôte peuvent avoir une influence considérable sur la santé humaine.

De nombreuses études ont pu mettre en évidence des corrélations entre une dysbiose fonctionnelle du microbiome intestinal, dans laquelle le nombre d'espèces bactériennes protectrices et bénéfiques est réduit et le nombre d'espèces pathogènes et nocives est augmenté, et différents états pathologiques (notamment l'obésité, la résistance à l'insuline, l'inflammation systémique de faible intensité, les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin comme la maladie de Crohn ou la rectocolite hémorragique).

En tant que l'une des couches protectrices de l'interface intestinale, qui représente la plus grande surface de contact du corps avec l'environnement, le microbiome exerce des fonctions décisives qui empêchent l'intrusion de germes ou de toxines pathogènes et les maladies qui en résultent. De plus, un microbiome intestinal équilibré est essentiel pour la santé de la muqueuse intestinale et la physiologie fonctionnelle de l'intestin.



Avec le séquençage de nouvelle génération (next generation sequencing, NGS), des régions de l'ARNr 16S bactérien sont amplifiées, séquencées et les séquences obtenues sont ensuite analysées de manière bioinformatique.


Contenu: Diagnostic du microbiome intestinal chez labor team (Profil 20177)
- Nombre d'espèces & biodiversité
- Entérotypes
- Ratio Firmicutes / Bactéroïdes
- Bactéries productrices d'acide lactique
- Flore étrangère provenant de la bouche ou du pharynx
- Protéobactéries : bactéries productrices de SCFAs (short chain fatty acids; acides gras à chaîne courte, AGCC)
- Bactéries productrices de l'équol
- Bactéries productrices de gaz sulfureux
- Évaluation des résultats individuels
- Remarques générales sur les résultats concernant le microbiome fécal


Des selles stabilisées (tubes "DNA/RNA-Shield") sont nécessaires pour l'analyse.
A cet effet, le kit de prélèvement de selles M900571 peut être commandé chez nous.

=> Kit de prélèvement de selles référence : M900571
- 1x tube ADN/ARN avec stabilisateur (tube "DNA/RNA-Shield")
- Collecteur de selles (aide en papier pour ramasser les selles pour les toilettes)
- Instructions pour le prélèvement de selles


L'analyse est effectuée par lots et prend environ 15 jours ouvrables.




Littérature:

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- Round, J. L., & Mazmanian, S. K. (2009). The gut microbiota shapes intestinal immune responses during health and disease. Nature Reviews Immunology, 9(5), 313–323. https://doi.org/10.1038/nri2515



- Thursby, E., & Juge, N. (2017). Introduction to the human gut microbiota. Biochemical Journal, 474(11), 1823–1836. https://doi.org/10.1042/bcj20160510



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